Hovedforskellen mellem auxin og cytokinin er, at auxin stimulerer rodforgrening, mens cytokinin hæmmer rodforgrening og lateral roddannelse. For at tilføje mere til dette er auxin hovedsagelig ansvarlig for forlængelse af celler i stilken og rodspidserne, mens cytokininer er hovedsageligt ansvarlige for celledeling, og derfor findes de i voksende områder.
Fytohormoner, også kendt som plantehormoner, er vigtige kemiske stoffer til plantevækst og -udvikling. De er organiske molekyler, og de fungerer som signalmolekyler, der regulerer planteudviklingen. Der er fem hovedtyper af plantehormoner: auxin, gibberellin, cytokinin, ethylen og abscisinsyre. Således udfører de forskellige funktioner alene og sammen for at påvirke plantevækst.