Hovedforskellen mellem calciumhypochlorit og natriumhypochlorit er, at calciumhypochlorit indeholder to hypochloritanioner forbundet med en calciumkation, mens natriumhypochlorit indeholder en hypochloritanion forbundet med en natriumkation. Tilsyneladende er calciumhypochlorit et hvidt til et gråt pulver, mens natriumhypochlorit er et grøngult fast stof med en sød lugt.
Calcium og natriumhypochlorit er ioniske forbindelser indeholdende et metalkation og en klorafledt anion. Antallet af anioner pr. Kation af disse forbindelser adskiller sig fra hinanden alt efter metalkationens valens.
