Hovedforskellen mellem geografisk og reproduktiv isolation er, at den geografiske isolation er en kategori af reproduktiv isolation, der refererer til adskillelsen af populationer af organismer fra parring eller udveksling af deres genetiske materiale ved fysiske grænser, mens reproduktiv isolation henviser til et sæt mekanismer, der forhindrer arter fra parring og at producere frugtbare afkom.
Befrugtning er foreningen af en sæd og et æg til dannelse af en diploid zygote under den seksuelle reproduktion. Hvis den producerede zygote er moden, vil den til sidst vokse til et sundt frugtbart afkom. reproduktiv isolation er derfor en proces, der forhindrer dannelsen af et frugtbart afkom. Denne forebyggelse kan forekomme under befrugtningsprocessen eller efter befrugtning. I sidste ende skaber det i sidste ende en barriere for at producere et frugtbart afkom, der kan føde et andet frugtbart afkom. Blandt de forskellige mekanismer er geografisk isolation en faktor for reproduktiv isolation.
