Hovedforskellen mellem Prostaglandin E1 og E2 er, at prostaglandin El (PGE1) er en antiinflammatorisk faktor, mens Prostaglandin E2 (PGE2) er en proinflammatorisk faktor.
Prostaglandiner er lipidafledte forbindelser, der har en hormonlignende funktion. De kan fungere som autokrine eller parakrine forbindelser, der medfører antagonistiske eller synergistiske virkninger i de levende organismer. Prostaglandin E1 og prostaglandin E2 er to typer, og de adskiller sig med hensyn til funktionaliteten i inflammation. Både prostaglandin E1 og E2 tilhører den samme familie af prostaglandin E2, og deres reaktionsgrundlag og deres virkninger er endnu ikke fuldstændigt belyst. De bruges til behandling af forskellige biokemiske mekanismer hos levende væsener.
