Hovedforskellen mellem makroskopisk og mikroskopisk er, at udtrykket makroskopisk henviser til stoffer, der er synlige for det blotte øje, mens udtrykket mikroskopisk henviser til stoffer, der er usynlige for det blotte øje.
Udtrykkene makroskopisk og mikroskopisk henviser til to forskellige skalaer, der er nyttige til bestemmelse af størrelsen af forskellige forbindelser. Makroskopiske stoffer er store nok til at blive set med det blotte øje uden forstørrelsesinstrument. Tværtimod er mikroskopiske stoffer meget små, som ikke er store nok til at blive set med det blotte øje. Således har vi brug for et forstørrelsesinstrument såsom et mikroskop for at undersøge disse stoffer.
