Hovedforskellen mellem grampositive og gramnegative bakterier er, at grampositive bakterier har et tykt peptidoglycanlag og derfor vises i lilla farve, mens gramnegative bakterier har et tyndt peptidoglycan-lag og derfor vises i lyserød farve i slutningen af gramfarvningsteknikken.
Bakterier er allestedsnærværende prokaryoter, som er encellede og mikroskopiske. De tilhører Kingdom Monera sammen med Archaea. Desuden har de en meget enkel cellulær organisation. Strukturelt mangler de indvendige rum; kerne og membranbundne andre organeller. Desuden kan bakterier klassificeres baseret på flere karakteristika, såsom form, genetisk sammensætning, cellevægssammensætning, antal flageller, ernæring, biokemiske reaktioner osv. Gramfarvning er en af de teknikker, der almindeligvis anvendes til identifikation og karakterisering af bakterier. I henhold til gramfarvning er der to kategorier af bakterier, såsom grampositive og gramnegative bakterier. Disse to grupper af bakterier adskiller sig fra hinanden ved hjælp af cellevægssammensætningen. Derfor pletter de i forskellige farver under gramfarvningsteknikken.
