Hovedforskellen mellem parasit og bakterier er, at bakterierne er encellede mikroskopiske prokaryoter, der lever overalt, mens parasitter er de organismer, der lever på eller i deres værter, mens de forårsager infektioner til værter.
Parasit og bakterier er organismer, der ligner meget primitive organismer, men som har store tilpasninger for at overleve under forskellige miljøforhold. For mennesker er disse organismer altafgørende, fordi størstedelen af menneskelige infektioner er forårsaget af dem. Nogle gange betragtes visse bakterier som parasitter.
