Hovedforskellen mellem hydrofobe og hydrofile aminosyrer er, at de hydrofobe aminosyrer er upolære, mens de hydrofile aminosyrer er polære.
Aminosyrer er byggestenene i proteiner. Et protein er et kæmpe polymermolekyle, som er en væsentlig komponent i alle levende organismer. Desuden er aminosyrer hovedsageligt i to typer som essentielle og ikke-essentielle aminosyrer. Desuden kan vi kategorisere dem som hydrofile og hydrofobe aminosyrer afhængigt af deres fysisk-kemiske natur. De adskiller sig fra hinanden, hovedsageligt baseret på polariteten.
