Hovedforskellen mellem navlestrengsblod og knoglemarvsstamceller er, at stamcellerne i navlestrengsblod er de hæmatopoietiske celler, der er til stede i navlestrengen hos den nyfødte efter fødslen, mens knoglemarvets stamceller er de stamceller, der er til stede i knoglemarven væv af individer.
Stamcelletransplantation er en almindelig terapeutisk procedure, hvor en patient modtager en dosis bloddannende (stamceller) for at erstatte deres egne ødelagte celler med sygdom eller ved andre terapeutiske procedurer. Både stamceller fra navlestrengsblod og stamceller fra knoglemarv har terapeutiske formål (transplantationer). Derfor er en almindelig anvendelse af disse stamceller at erstatte de usunde celler med en sund. Klinisk er de mest almindelige kilder til sunde celler navlestrengsceller og knoglemarvsceller.