Hovedforskellen mellem dominerende og recessive alleler er, at dominerende alleler er de alleler, der giver fænotypen og maskerer over den anden fænotype, mens recessive alleler er de alleler, der undertrykkes af den dominerende allel.
Normalt indeholder et kromosom et antal gener, og de findes på bestemte steder. Hvis gener findes på samme sted i de homologe kromosomer, siges de at have det samme sted. Da de er til stede i samme loci i det maternelle og faderlige kromosom, har disse gener det samme træk. De er de alternative former for et gen; vi kalder disse alleler. Alleler kan være dominerende eller recessive. En dominerende allel giver altid den fænotype, den koder, mens den recessive allel kun giver fænotypen, når den er til stede i den homozygote tilstand. Faktisk er dominans og recessivitet den fænotypiske sammenhæng mellem to alleler.