Hovedforskellen mellem septat- og aseptathyfer er, at septathyfer har septa eller tværvæggene, der opdeler hyfer i forskellige celler, mens aseptathyfer mangler septa.
Hyfer er lange filamenter eller trådlignende strukturer af svampe. Hyfer er den vegetative struktur af svampe. Mycelium er en samling af hyfer af en svamp. Svampehyfer består af celler omgivet af en cellevæg fremstillet af chitin. For at adskille celler i hyferne er der perforerede tværvægge kaldet septa. Men septa er ikke til stede i hyfer af alle svampe. Derfor, baseret på tilstedeværelsen og fraværet af septa, har hyfer to typer: septathyfer og aseptathyfer.