Hovedforskellen mellem genetisk kort og koblingskort er typen af gener, der bruges til kortlægningsprocessen. Genetisk kort består af alle gener til stede på et bestemt kromosom, mens koblingskort består af sammenkædede gener til stede på et bestemt kromosom.
Genetisk kort og koblingskort er to typer kromosomale kort, der illustrerer gener, der findes på kromosomerne. Et genetisk kort viser alle generne, mens et koblingskort kun viser de sammenkædede gener. Begge er meget nyttige til diagnosticering af genetiske sygdomme og lidelser. Derudover kan kromosomafvigelser også påvises ved hjælp af genetiske kort og koblingskort. Tilknytningskort giver yderligere en idé om udviklingen af bestemte gener.