Hovedforskellen mellem Ubiquinones og Cytochromes er, at Ubiquinones (CoQ) ikke er proteiner, mens Cytochromes er proteiner.
Elektron transportkæde er den sidste fase af aerob respiration. Derfor forekommer det i den indre membran af mitokondrier. Desuden består den af elektronbærere, der letter produktionen af en protongradient over membranen. Bortset fra NAD og flavoproteiner er Ubiquinones og Cytochromes to typer elektronbærere involveret i elektrontransportkæden. Ubiquinoner er ikke-protein-lipidopløselige, hydrofobe organiske molekyler, mens cytokromer er jernholdige proteiner.
