Hovedforskellen mellem rhizom og stolon er, at rhizom er den rodlignende hovedstamme, der vokser under jorden, mens stolon er en stilk, der er spiret fra den eksisterende stilk, der løber vandret lige under jordoverfladen for at danne en ny plante og forbinde med moderplanten.
Rhizomes og stolons er specielle strukturer af planter. De er afgørende i vegetativ reproduktion. Begge dele kan også gemme fødevarer. Ikke kun det, begge hjælper planter med at overleve under barske miljøforhold. Strukturelt er de stængler. Rhizomet er hovedstammen, der ligger under jorden, mens stolon er en stilk, der er spiret fra hovedstammen, der løber vandret på jorden.