Hovedforskellen mellem kemoorganotrofer og kemolitotrofer er, at kemoorganotrofer er organismer, der opnår elektroner fra organiske forbindelser, mens kemolithotrofer er organismer, der opnår elektroner fra uorganiske forbindelser.
Levende organismer kan grupperes i flere kategorier i forhold til ernæringstilstanden baseret på energikilden og kulstof. Der er energikilder som sollys og organiske forbindelser. Tilsvarende er der to typer kilder til kulstof som uorganisk kulstof og organisk kulstof. De fire hovedkategorier er fotoautotrofer, fotoheterotrofer, kemoautotrofer og kemoheterotrofer. Desuden er der baseret på den primære kilde til reducerende ækvivalent to kategorier som organotrofer og litotrofer. Chemoorganotrophs og chemolithotrophs er to grupper, der bruger energi fra at bryde kemiske forbindelser. Men de adskiller sig fra hinanden baseret på elektrondonoren. Kilden til elektrondonor er organiske forbindelser i kemoorganotrofer, mens kilden til reducerende ækvivalent er uorganisk i kemolitotrofer.
