Hovedforskellen mellem Agnathans og Gnathostomata er, at Agnathans er organismer, der ikke har en kæbe, mens Gnathostomata er organismer med kæber. Denne nøgleforskel spiller en vigtig rolle i form af fodring, de gennemgår.
Agnathans er kæbefri fisk. Gnathostomata er fisk, der har kæber. Både agnathans og Gnathostomata er meget vigtige til bestemmelse af evolutionære forhold. De er hvirveldyr og lever i vandmiljøer. De viser forskellige mønstre for deres overlevelse. Imidlertid er de tidligste organismer i hver gruppe nu uddøde.
