Hovedforskellen mellem homonukleære og heteronukleære aromatiske forbindelser er, at de homonukleære aromatiske forbindelser indeholder atomer med de samme kemiske grundstoffer i ringstrukturen, mens de heteronukleære aromatiske forbindelser indeholder atomer med forskellige kemiske grundstoffer i ringstrukturen.
Homonukleære og heteronukleære aromatiske forbindelser er organiske forbindelser indeholdende ringstrukturer. Og disse ringstrukturer indeholder enten identiske atomer eller forskellige atomer. Derfor har de forskellige kemiske og fysiske egenskaber afhængigt af typen af atomer i ringstrukturerne.