Hovedforskellen mellem cytotoksicitet og genotoksicitet er, at cytotoksicitet er kvaliteten af at være toksisk for celler, mens genotoksicitet er evnen til at beskadige DNA og / eller det cellulære apparat, der regulerer genomets troskab.
Cytotoksicitet og genotoksicitet er to egenskaber ved kemiske stoffer eller lægemidler. Cytotoksicitet er kvaliteten af at være toksisk for celler, mens genotoksicitet er kvaliteten af at skade den genetiske information inden i en celle og forårsage mutationer. Noget giftigt kemikalie kan inducere både cytotoksicitet og genotoksicitet. Genotoksicitet kan også føre til cytotoksicitet. På den anden side kan cytotoksicitet muligvis være genotoksisk, da ikke alle cytotoksiske stoffer er genotoksiske.