siRNA vs miRNA
RNA'er er meget vigtige molekyler, som hjælper med at opbygge organismenes liv. For nylig har forskere opdaget små RNA'er kaldet RNA-interferens eller RNAi, som virker efter transkriptionen for at kontrollere genekspression. De to hovedtyper af små RNA'er er mikro-RNA eller miRNA og lille interfererende RNA eller siRNA. Disse molekyler regulerer grundlæggende genekspressionen ved at undertrykke målgenet. Både miRNA og siRNA har meget lignende biogeneseveje, selvom der er nogle forskelle mellem dem. Oprindelsen af miRNA og siRNA er fra dsRNA-molekyler. Modne miRNA'er ligner strukturelt siRNA-molekyler.
miRNA
Mikro-RNA'er eller miRNA'er er de små RNA-molekyler, der medierer den sidste kontrol i translationel genregulering. Deregulering af miRNA kan føre til kræft og anden sygdomsudvikling. Derfor er den korrekte regulering af information kodet i den ikke-kodende region af miRNA meget kritisk i mange grundlæggende cellulære processer.
siRNA
siRNA'er betegnes også som kort interfererende eller lyddæmpende RNA og består af dobbeltstrenget RNA med 20 til 25 basepar. Hovedrollen for siRNA er at interferere med ekspressionen af specifikke gener med komplementære nukleotidsekvenser. siRNA består af kort dobbeltstrenget RNA med phosphorylerede 5'-ender og hydroxylerede 3'-ender med to overhængende nukleotider.
Hvad er forskellen mellem siRNA og miRNA?
• miRNA afledt af specifikke genomiske loci, mens siRNA afledt af mRNA, transposoner, vira eller heterokromatisk DNA.
• Syntese af miRNA behandles fra længere precursor-hårnålstranskripter (primær nuklear miRNA-sekvens ved RNase III-endonuklease), mens siRNA behandles fra lange bimolekylære RNA-duplekser.
• Hvert miRNA-hårnålsforløbermolekyle producerer enkelt miRNA-duplex, hvorimod hvert siRNA-forstadiemolekyle producerer flere siRNA-duplekser.
• siRNA-sekvenser konserveres sjældent, mens miRNA-sekvenser er godt konserverede.
• Alle baser inden for siRNA bidrager til dets målspecificitet, hvorimod kun 5 'halvdelen af miRNA bidrager til dets målspecificitet.
• miRNA binder ofte til den 3'-utranslaterede region af måltranskripter, mens siRNA'er danner komplementær duplex hvor som helst langs et mål-mRNA.
• miRNA angiver 'hetero-silencing', mens siRNA bruges til 'auto-silencing'.
• miRNA fungerer som et signal til at forhindre translation, mens siRNA fysisk forhindrer translation.
