Nøgleforskel - Genotypning vs sekventering
Genotypebestemmelse og sekventering er to teknikker, der udføres for at opnå information om nukleinsyrerne, hovedsageligt DNA i en organisme. Hovedforskellen mellem genotypebestemmelse og sekventering er, at genotypebestemmelse er processen til bestemmelse af, hvilken genetisk variant individet besidder ved hjælp af markører, mens sekventering er bestemmelsen af den rigtige rækkefølge af nukleotidsekvensen inden for det givne DNA-fragment.
INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er genotypebestemmelse
3. Hvad er sekventering
4. Sammenligning side om side - Genotypebestemmelse vs sekventering
5. Resume
Hvad er genotypebestemmelse?
Genotypebestemmelse er bestemmelsen af den enkeltes genetiske sammensætning ved hjælp af en sekvens af DNA og markører og sammenligning og identifikation af dens arv. Genotypebestemmelse er vigtig i evolutionær biologi, populationsbiologi, taksonomi, økologi og genetik hos organismerne. Det kan udføres ved forskellige teknikker, herunder DNA-sekventering, polymerasekædereaktion, restriktionsfragmentlængde-polymorfisme (RFLP), tilfældig amplificeret polymorf detektion, amplificeret fragmentlængdepolymorfisme (AFLP), DNA-mikroarrays osv.
Genotypebestemmelse involverer sekventering af bestemte små fragmenter af DNA-sekvenser og fund af sammenhæng mellem den genetiske sammensætning og andre individer ved hjælp af genetiske markører. Det bestemmer de enkelte nukleotidpolymorfier (SNP'er) blandt individerne eller de specifikke alleler. Genotypebestemmelse kan anvendes på en lang række organismer, herunder mennesker. Det er også anvendeligt til mikroorganismer såsom vira, svampe osv. Og kan bruges til at bestemme deres genetiske varianter med referenceprofilerne. I molekylær epidemiologi og retsmedicinsk mikrobiologi udføres kontrol af patogener, især mikroorganismer, ved hjælp af de oplysninger, der opnås ved genotypebestemmelse. Genotypebestemmelse er meget vigtig i stamtavle-analyse. Mennesker genotypes for at bekræfte moderskab og faderskab. Genotype afslører de dominerende og recessive gener af gener, der bestemmer specifikke træk.
Figur_1: RFLP-genotypebestemmelse
Hvad er sekventering?
Sekventering er processen med at bestemme den korrekte rækkefølge af nukleotidet i et givet fragment af DNA eller RNA. Næsten al information, der kræves til vækst og udvikling af en organisme, er kodet i dens genom. Tilgængeligheden af teknikker til at producere og adskille nogle få hundrede nukleotidfragmenter med nukleinsyrer førte til udviklingen af procedurer til bestemmelse af den nøjagtige nukleotidsekvens for et givet DNA- eller RNA-fragment. Forskellige typer af sekventeringsmetoder er tilgængelige i dag. Disse sekventeringsmetoder sammen med teknologierne til konstruktion af genombiblioteker, der repræsenterer hele en organisms genom, letter sekventeringen af hele genomet i den organisme ved at foretage en dybdegående analyse af genstrukturer, genfunktioner, genplaceringer, genekspressioner, genkortlægning, genregulerende regioner osv.
Den samlede genom af mange vira, adskillige bakterier, archaebakterier, gær og flere andre organismer er blevet sekventeret og kortlagt. Menneskeligt genom-projekt har gjort det muligt at sekvensere og kortlægge hele det menneskelige genom og offentliggøre sit første udkast i 2003. Det er en vigtig milepæl i udviklingen af biologien. Humane genom-sekvenser bruges nu i den medicinske sektor til at identificere genetiske årsager til sjældne sygdomme, screenes sygdomsrisiko hos nyfødte, identificere genetiske detaljer om forskellige kræftformer, udvikle nye terapier og udvikle nye diagnostiske værktøjer osv.
I planteverdenen er risgenomet og Arabidopsis-genomerne blevet sekventeret. Kendskab til disse sekvenser vil utvivlsomt revolutionere vores forståelse af, hvordan celler og organismer fungerer.
Figur_2: En autoradiografi af sanger-sekventering
Hvad er forskellen mellem genotypebestemmelse og sekventering?
Diff artikel midt foran bordet
Genotypning vs sekventering |
|
| Genotypebestemmelse er processen til bestemmelse af den enkeltes genetiske sammensætning og kontrol af organismenes gruppe eller taksonomi. | Sekventering er processen til bestemmelse af den nøjagtige rækkefølge af nukleotider af et givet DNA eller RNA-fragment. |
| Teknikker | |
| RFLP, gensekventering, PCR, DNA-mikroarrays, AFLP osv. | Sanger-sekventering, Gilbert-sekventering, Pyrosequencing, Next Generation-sekventering, Shotgun-sekventering osv. |
| Store bekymringer | |
| Dette er mere bekymret for, om genotype forskelle giver de faktiske fænotype forskelle. | Dette er mere bekymret over rækkefølgen af nukleotiderne og dens forskelle og ændringer med andre organismer. |
Resumé - Genotypning vs sekventering
Genotypebestemmelse og sekventering er nyttige til at studere organismernes genetiske information. Genotypebestemmelse er processen med at bestemme genotypevariationer blandt individer og finde deres kategorier. Sekventering er processen til bestemmelse af den korrekte rækkefølge af nukleotiderne i det interesserede fragment eller DNA-regionen. Begge teknikker giver vigtig information om generne og genomerne.
