Nøgleforskel - Metabolomics vs Metabonomics
Metabolitter er de små molekyler, der er involveret i metaboliske reaktioner i cellerne. Metabolitter inkluderer metaboliske mellemprodukter, hormoner, sekundære metabolitter, signalmolekyler osv. De er de fungerende molekyler af cellernes biokemiske reaktioner. Et komplet sæt metabolitter fra en biologisk prøve eller en enkelt organisme er kendt som metabolom. Metabolom er en dynamisk samling, der skifter hvert sekund i kroppen. Metabolomics og metabonomics er to udtryk relateret til studiet af metabolism af en organisme. Hovedforskellen mellem metabolomics og metabonomics er, at metabolomics er mere bekymret over normal endogen metabolisme og metabolisk profilering på celle- eller organniveau, mens metabonomics er mere bekymret for at udvide metabolisk profilering med informationen om forstyrrelser af metabolisme på grund af miljøfaktorer, sygdomme, tarm mikroorganismer og sammenligning af metabolisk profilering osv. Metabolomics er hovedsageligt drevet af massespektrometri, og metabonomi bruger NMR-spektroskopi til metabolitanalyse.
INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er Metabolomics
3. Hvad er Metabonomics
4. Sammenligning side om side - Metabolomics vs Metabonomics
5. Resume
Hvad er Metabolomics?
Metabolomics er studiet af metaboliske processer, der forekommer i celler, biofluider, væv eller organismer. Det inkluderer identifikation og kvantificering af cellulære metabolitter ved hjælp af gode analytiske og statistiske værktøjer. Metabolomics betragtes som en vigtig undersøgelse, da den afslører oplysninger om en organisms stofskifte.
For at studere substrater og produkter af metaboliske reaktioner bruger metabolomics massespektrometri som en analytisk platform. Massespektrometri afslører typer af metabolitter og deres koncentrationer, hvilket afspejler den faktiske biokemiske tilstand af cellerne eller vævene. Derfor kan metabolomics betragtes som den bedste repræsentant for molekylær fænotype af en organisme. Metabolomics er en omisk teknologi af små molekyler i organismerne og sammenlignet med andre omiske undersøgelser; metabolomics er meget vigtigt, da det direkte afspejler den aktuelle status for cellernes biokemiske reaktion.
Metabolomics kan også betragtes som en udvidelse af proteomics, fordi de genereres på grund af aktiviteterne af enzymer, som er proteiner som vist i den følgende figur.
Figur 01: Metabolomics-ordning
Hvad er metabonomi?
Metabonomi er defineret som en kvantitativ måling af multiparametriske metaboliske reaktioner på bestemte tidspunkter i forhold til patofysiologiske belastninger eller genetisk modifikation. Dette anvendes normalt til undersøgelser, der er udført om human ernæring og reaktioner på stoffer eller sygdomme. Denne tilgang blev banebrydende af Jeremy Nicholson på Imperial College, London, og den er blevet brugt inden for en række områder, herunder toksikologi, sygdomsdiagnose, ernæring osv. Historisk set var metabonomi en af de første metoder til at anvende omfanget af systembiologi til studier af stofskifte.
Metabonomics er mere bekymret for at sammenligne biokemiske profiler snarere end at identificere individuelle metaboliske forbindelser i metabolomics. Derfor kan metabonomi defineres som en delmængde af metabolomics. Det understreger hovedsageligt sammenligningen af metaboliske profiler fra forskellige populationer med hensyn til sygdomme, miljøbelastninger, genetisk modifikation, ernæring, lægemidler osv., Fordi metabolitter er de gode markører, der signalerer sygdomsbetingelser, virkninger af stoffer, miljøbelastninger, eksponering for toksiner, etc.
Metabonomiske undersøgelser afslører både intracellulære og ekstracellulære metabolitter. Det bruger teknikker med høj kapacitet til at analysere et stort antal metabolitter samtidigt og gentagne gange, hvilket muliggør tidsmæssig undersøgelse af cellernes fysiologiske status. Det afslører også sammenhængen mellem metabolitter og organismenes patologiske status. For at understøtte metabonomiske undersøgelser kan genomik og proteomik bruges, da de er indbyrdes forbundne som vist i ovenstående figur.
Hvad er forskellen mellem Metabolomics og Metabonomics?
Diff artikel midt foran bordet
Metabolomics vs Metabonomics |
|
| Metabolomics er studiet af det komplette sæt af metabolitter i en organisme | Metabonomi er den kvantitative undersøgelse af multiparametriske metaboliske reaktioner i levende systemer på tidsmæssig basis til patofysiologiske stimuli eller genetisk modifikation. |
| Største bekymring | |
| Metabolomics er mere optaget af metabolisk profilering og identifikation af individuelle metabolitter til stede i cellerne. | Metabonomi er mere optaget af at sammenligne metabolitter eller metaboliske profiler af populationer i forhold til genetiske modifikationer, sygdomme, miljøbelastninger, patologiske stimuli, stoffer osv. |
| Information | |
| Metabolomics er primært fokuseret på endogen metabolisme. | Metabonomi er ikke begrænset til endogen metabolisme. Det strækker sig til at finde information om forstyrrelser i stofskiftet forårsaget af interne og eksterne faktorer såsom diætmønstre, toksiner, sygdomsprocesser osv. |
| Analytiske værktøjer | |
| Det bruger massespektrometri som den vigtigste analytiske platform | Metabonomics bruger NMR-spektroskopi som den vigtigste analytiske platform. |
Resumé - Metabolomics vs Metabonomics
Metabolom repræsenterer det komplette sæt af små molekyler kaldet metabolitter til stede i en celle eller i en organisme. Metabolomics er undersøgelsen af hele metabolomet for at generere den metaboliske profil. Metabolomics tillader forskere at måle den faktiske fysiologiske status for cellen eller organismen. Metabonomics er en del af metabolomics, der strækker sig til at udtrække information om de multiparametriske metaboliske reaktioner i levende systemer på patofysiologiske stimuli og genetiske modifikationer. Metabonomi handler ikke kun om individuel metabolisk profilering som metabolomics; den sammenligner metaboliske profiler i forhold til andre faktorer såsom miljøbelastninger, sygdomme, toksiner osv. Både metabolomics og metabonomics involverer undersøgelser af organismernes metabolitter for at måle cellernes faktiske fysiologiske status. Derfornogle gange betragtes disse to som synonymer uden at overveje forskellen mellem metabolomics og metabonomics.
