Nøgleforskel - VNTR vs STR
DNA-undersøgelser har enorm nytte til forståelse og bestemmelse af fylogenetiske forhold, diagnosticering af genetiske sygdomme og kortlægning af organismernes genomer. Flere teknikker associeret med DNA-analyse anvendes til identifikation af et bestemt gen eller en DNA-sekvens i en pool af ukendt DNA. De er kendt som genetiske markører. Genetiske markører anvendes i molekylærbiologi til at identificere genetisk variation mellem individer og arter. Variabelt antal tandem-gentagelse (VNTR) og kort tandem-gentagelse (STR) er to typer genetiske markører, der viser polymorfisme blandt individer. Begge typer er ikke-kodende gentagne DNA, som er tandem-gentagelser. De er arrangeret i en hoved til hale mode i kromosomer. VNTR er en sektion af genomet, hvor kort nukleotidsekvens gentages flere gange. STR er en anden del af DNA inden for genomet, som er organiseret som gentagne enheder bestående af to til tretten nukleotider i hundrede gange. Nøgleforskellen mellem VNTR og STR er antallet af nukleotider i en gentagende sekvens. Gentagne enheder af VNTR består af 10 til 100 nukleotider, mens gentagne enheder af STR består af 2 til 13 nukleotider. VNTR og STR anvendes bredt i retsmedicinske studier.
INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er VNTR
3. Hvad er STR
4. Ligheder mellem VNTR og STR
5. Sammenligning side om side - VNTR vs STR i tabelform
6. Resumé
Hvad er VNTR?
En tandem-gentagelse er en kort sekvens af DNA, der gentages i hoved til hale-mode på et specifikt kromosomalt sted. Der er ingen anden sekvens eller nukleotid inden for tandem-gentagelsen. Der er flere typer tandem-gentagelser i genomet. VNTR er en type tandem-gentagelse blandt dem, der har gentagne enheder bestående af 10 til 100 nukleotider. VNTR er en type minisatellit. Disse tandem-gentagelser kan findes i mange kromosomer. De er spredt ind i det menneskelige genom og ligger overvejende i de subtelomere regioner i kromosomer.
VNTR'er viser gentagen polymorfisme blandt individer. Længden af VNTR på en bestemt placering af kromosomet er meget variabel blandt individer på grund af variationen i antallet af gentagne enheder organiseret i det DNA-afsnit. Derfor kan VNTR bruges som et kraftfuldt værktøj til identifikation af enkeltpersoner, og VNTR-analyse bruges på mange områder, herunder genetik, biologiforskning, retsmedicin og DNA-fingeraftryk. VNTR'er var de første genetiske markører, der blev brugt til at kvantificere engraftment af knoglemarvstransplantation. VNTR'er var også de første polymorfe markører, der blev brugt til DNA-profilering i retsmedicin.
Figur 01: Variation af VNTR'er i seks individer
VNTR-analyse udføres via polymorfisme med restriktionsfragmentlængde efterfulgt af sydlig hybridisering. Derfor har det brug for forholdsvis en stor DNA-prøve. VNTR-profilfortolkning er også problematisk. På grund af disse begrænsninger har brugen af VNTR i retsmedicinsk genetik været begrænset, og den erstattes af STR-analyse.
Hvad er STR?
STR er en meget gentagen DNA-sektion, der består af to til tretten nukleotid-gentagende enheder organiseret på en tandem måde. STR svarer til VNTR. Men det varierer fra VNTR fra antallet af nukleotider i en gentagende sekvens og antallet af gentagelser. STR er en type mikrosatellit.
STR-analyse involveret i måling af det nøjagtige antal gentagne enheder. STR'er er meget variable blandt individer, svarende til VNT'er. STR-profiler adskiller sig fra person til person. Derfor anvendes STR-analyse i molekylærbiologi til at sammenligne specifikke loci på DNA fra to eller flere prøver. Derfor betragtes STR'er som kraftige genetiske markører i molekylærbiologi. Det giver et fremragende værktøj til identifikation af enkeltpersoner på grund af deres høje grad af polymorfisme og relativt kort længde.
På nuværende tidspunkt er STR'er det mest anvendte analyserede genetiske polymorfismeværktøj inden for retsmedicinsk genetik. De fleste retsmedicinske sager involverer polymorf analyse af STR. STR loci er spredt over hele genomet. Der er tusindvis af STR'er placeret i kromosomer, som kan bruges i retsmedicinsk analyse. STR-analyse involverer ikke begrænsningslængdepolymorfisme som VNTR-analyse. STR-analyse skærer ikke DNA med restriktionsenzymer. Specifikke prober anvendes til at binde ønskede regioner til DNA og ved hjælp af PCR-teknik bestemmes længderne af STR.
Figur 02: STR variation mellem prøver
Hvad er ligheden mellem VNTR og STR?
- VNTR og STR er ikke-kodende DNA.
- Begge er tandem-gentagelser.
- Begge viser polymorfisme blandt individer på grund af forskellen i længden af DNA-sektionen.
- Begge bruges som stærke genetiske markører i DNA-fingeraftryk og i retsmedicinske studier.
Hvad er forskellen mellem VNTR og STR?
Diff artikel midt foran bordet
VNTR vs STR |
|
| VNTR er et ikke-kodende gentagende DNA, der har en kort nukleotidsekvens gentaget på en tandem måde. | STR er en meget gentagen DNA-sektion, der består af to til tretten nukleotid-gentagende enheder organiseret på en tandem måde. |
| Størrelse | |
| VNTR'er er større end STR'er. | STR'er er mindre end VNTR'er. |
| Antal nukleotider i gentagen sekvens | |
| Den gentagne enhed af VNTR består af 10 til 100 nukleotider. | Den gentagne enhed af STR består af 2 til 13 nukleotider. |
Resumé - VNTR vs STR
VNTR og STR er to stærke genetiske markører, der anvendes i molekylærbiologi, især inden for retsmedicinsk genetik. VNTR er en type minisatellit og STR er en mikrosatellit. VNTR og STR er ikke-kodende, meget gentagne DNA. De er tandem gentagelser. Den generelle struktur for VNTR og STR er den samme. Antallet af nukleotider i den gentagne sekvens og længden er imidlertid forskellige. VNTR har gentagne sekvenser bestående af 10 til 100 nukleotider. STR har gentagne sekvenser bestående af 2 til 13 nukleotider. Dette er forskellen mellem VNTR og STR.
Download PDF-version af VNTR vs STR
Du kan downloade PDF-version af denne artikel og bruge den til offlineformål som pr. Citatnotater. Download venligst PDF-version her Forskellen mellem VNTR og STR.
