Hovedforskellen mellem borazin og benzen er, at borazinet indeholder tre boratomer og tre nitrogenatomer i ringstrukturen, mens benzen indeholder seks carbonatomer i ringstrukturen.
Både borazin og benzen har lignende strukturer med en seksleddet ring, og disse to forbindelser er isoelektroniske. Det betyder, at både borazin og benzen har det samme antal elektroner eller den samme elektroniske struktur. De har dog helt forskellige kemiske og fysiske egenskaber, fordi ringene til disse forbindelser består af forskellige atomer.