Hovedforskellen mellem stomata og beskyttelsesceller er, at stomataen er porer, der lokaliserer sig på epidermis af blade, stængler osv., Mens beskyttelsescellerne er de celler, der omgiver og regulerer åbning og lukning af stomata.
Åndedræt og fotosyntese er to vitale processer i planter. I begge processer er gasudveksling vigtig. Stomata og beskyttelsesceller letter dette job med gasudveksling i planter. Her er beskyttelsescellerne parenkymceller, og de er cellerne, der omgiver stomata. Beskyttelsesceller kontrollerer transpiration, hvilket er en vigtig proces af planter, der holder planterne sunde. Desuden indeholder beskyttelsescellerne klorofyl. Derfor er de også i stand til fotosyntetisering.
