Hovedforskellen mellem genom og genpulje er, at genomet henviser til hele en organisms DNA, mens genpuljen refererer til det komplette sæt af unikke gener i en interbreedingpopulation.
Gen er arvelighedens grundlæggende strukturelle enhed. Gener passerer fra forældre til afkom via kønsceller. De er også til stede i genomet af en organisme. Genom er det komplette sæt DNA i en organisme. Genpool er også et lignende udtryk. Men det repræsenterer samlingen af alle gener, der er til stede i en population eller en art. I modsætning til genomet er genpool en blanding af gener fra en population. Følgelig repræsenterer genpuljen alle mulige alleler, der er til stede i den pågældende population.
