Hovedforskellen mellem Bombay-blodgruppe og O-blodgruppe er, at Bombay-blodgruppen ikke har H-antigener på de røde blodlegemer, men indeholder H-antistoffer, mens O-blodgruppen har H-antigener, men ikke indeholder H-antistoffer.
Der er fire hovedblodgrupper; nemlig A, B, AB og O. Bortset fra disse fire; der er sjældne blodgrupper til stede blandt folket. Bombay blodgruppe er en af de sjældneste typer blodgrupper, der kun findes i 4 mennesker pr. Million mennesker i verden. Det adskiller sig fra de ovennævnte fire blodgrupper på grund af fraværet af H-antigener. Dette skyldes fraværet af H-genet i genomet. Når man sammenligner Bombay-blodgruppe og O-blodgruppe, indeholder begge blodgrupper ikke A-antigener og B-antigener. Men O-blodgruppen indeholder H-gen; indeholder derfor H-antigener.
