Hovedforskellen mellem virus og prion er, at virussen er en lille smitsom partikel sammensat af nukleinsyrer og et proteinovertræk, mens prionen er en lille infektiøs partikel sammensat af et enkelt protein.
Der er forskellige typer biologiske enheder undersøgt af mikrobiologer. Blandt dem er virus og prion to typer acellulære infektiøse partikler. De betragtes ikke som levende organismer, da de viser flere ikke-levende egenskaber end levende egenskaber. Tilsvarende indeholder de ikke ribosomer og enzymer til at syntetisere proteiner. Derfor har de brug for en levende organisme (vært) for at formere sig. Desuden kan de ikke observeres under lysmikroskoper, og de kan ikke filtreres ud af Chamberland-filtre. Desuden er de ikke dyrkbare i næringsmedier. Forskellen mellem virus og prion skyldes hovedsageligt deres sammensætning. Virus består af nukleinsyrer og proteiner, mens prioner kun består af proteiner. Ligeledes er der flere forskelle mellem virus og prion, som denne artikel vil diskutere.
