Hovedforskellen mellem molekyle og gitter er, at et molekyle indeholder atomer bundet til hinanden, mens et gitter indeholder atomer, molekyler eller ioner bundet til hinanden.
Atomer går sammen for at danne forskellige kemiske stoffer. I henhold til deres arrangement ændres deres egenskaber. Den enkleste enhed, der kan dannes, når atomer binder hinanden, er et molekyle. Hvis et meget stort antal atomer, ioner eller molekyler kombineres med hinanden, er resultatet et gitter. Et gitter har en meget ordnet struktur og en meget høj molær masse.