Hovedforskellen mellem æggestok og æg er, at æggestokken er en del af den kvindelige reproduktive struktur, der udvikler sig til en frugt af blomstrende planter, mens æggestokken er en struktur, der udvikler sig til et frø af frøplanter.
Blomsten er den reproduktive struktur af blomstrende planter. Nogle blomster er perfekte, mens andre er ufuldkomne blomster. Perfekte blomster indeholder både den mandlige og kvindelige reproduktive del som henholdsvis androecium og gynoecium. Gynoecium har tre hovedkomponenter, nemlig stigma, stil og æggestok. Følgelig er æggestokken strukturen, der indeholder æggler. Vi kan finde det ved bunden af gynoecium. Således er ovules de strukturer, der bærer kvindelige reproduktive celler eller ægcellerne. Æggestokken omgiver æggene i blomst. Én æggestok kan indeholde mange æg, men en æg indeholder ofte en ægcelle (hunkøn). Efter befrugtning udvikler æggestok og æg til forskellige strukturer af en frugt.