Hovedforskellen mellem genomisk og plasmid-DNA er, at genomisk DNA er essentielt for organismernes overlevelse, herunder bakterier, mens plasmid-DNA ikke er essentielt for bakteriens overlevelse.
Hver levende organisme har genetisk materiale, der styrer dens overordnede funktion. Genetisk materiale findes hovedsageligt som kromosomalt DNA. I eukaryoter er genomisk DNA til stede inde i kernen, mens der i prokaryoter er genomisk DNA til stede i cytoplasmaet. Bortset fra kromosomalt DNA eller genomisk DNA har nogle organismer, herunder bakterier, arkæer og gær, ekstra-kromosomalt DNA kendt som plasmid-DNA. Plasmid-DNA er ikke essentielt for den daglige funktion af disse organismer. De giver dog nogle yderligere fordele for disse organismer, da de indeholder flere vigtige gener. Det er også vigtigt at bemærke, at disse gener ikke er så vitale som de gener, der findes i genomisk DNA. Så denne artikel forsøger at diskutere forskellen mellem genomisk og plasmid-DNA.