Hovedforskellen mellem transformation og transmutation er, at transformation er en ændring af genetisk sammensætning gennem genoverførsel for at medføre ændrede tegn, mens transmutation er den proces, der fuldstændigt ændrer organismen gennem påvirkning af en mutation.
Transformation og transmutation er to begreber, der vises inden for evolutionær biologi. Over tid har organismer transformeret og transmuteret for at tilpasse sig forskellige miljøforhold. Begge udtryk forklarer normalt det samme fænomen; der er dog en minutforskel mellem transformation og transmutation.