Hovedforskellen mellem Allogamy og Autogamy er, at Allogamy er fusionen af mandlige og kvindelige kønsceller, der kommer fra to forskellige individer, mens Autogamy er sammensmeltningen af mandlige og kvindelige kønsceller fra det samme individ. En anden forskel mellem allogami og autogami med hensyn til det producerede afkom er, at allogamien producerer et genetisk anderledes afkom, mens autogami producerer et genetisk identisk afkom.
Fusion af en mandlig gamete med en kvindelig gamete er befrugtning. En zygote udvikler sig som et resultat af befrugtning, og derefter gennemgår den celledeling for at producere et nyt afkom. Desuden kan befrugtning være to typer; selvbefrugtning eller krydsbefrugtning. Allogamy er et synonym for krydsbefrugtning, og Autogamy er et synonym for selvbefrugtning.
