Hovedforskellen mellem exencephaly og anencephaly er, at exencephaly er en cephalisk lidelse, hvor hjernevævet er placeret uden for kraniet på grund af fraværet af kraniehulrum og hovedbund. I mellemtiden er anencephaly en cephalic lidelse, som er karakteriseret ved fraværet af en stor del af hjernen, kraniet og hovedbunden på grund af den manglende lukning af den rostrale neuropore.
Medfødte lidelser opstår på grund af neurale defekter, der finder sted under graviditeten. De giver anledning til en høj grad af dødelighed, hvilket gør tilstanden dødelig. Exencephaly og anencephaly er to sådanne medfødte lidelser såvel som cephaliske lidelser, der ses hos spædbørn. I eksencephaly er hjernen placeret uden for kraniet. I anencephaly er en stor del af hjernen, kraniet og hovedbunden fraværende. Exencephaly betragtes som en embryologisk forløber for anencephaly. Imidlertid er exencephaly ekstremt en sjælden tilstand sammenlignet med anencephaly.