Hovedforskellen mellem agarbrønd og diskdiffusionsmetode er, at i agarbrønddiffusionsmetoden fyldes ekstraktopløsningen i et hul eller en brønd, der er skabt på agarmediet, mens en filterpapirskive indeholdende testopløsningen i placeres på agaroverfladen.
Mikroorganismer er midlerne til mange sygdomme. Der er forskellige antimikrobielle stoffer, der dræber mikroorganismer og hæmmer eller standser deres vækst. Forskellige screenings- og evalueringsmetoder er tilgængelige til påvisning af antimikrobiel aktivitet. Blandt dem er agarbrønd diffusionsmetode og agar skive diffusionsmetoder almindeligt anvendte metoder til in vitro analyse, som er agar diffusionsmetoder. Disse metoder anvendes i vid udstrækning, da de ikke kræver specificeret udstyr og yderligere evaluering for reproducerbarhed og standardisering. Begge metoder afhænger af diffusionen af det antimikrobielle middel gennem agarmediet.