Hovedforskellen mellem primær og sekundær allylic carbocation er, at primær allylic carbocation er mindre stabil end sekundær allylic carbocation.
En allylisk carbocation er en resonansstabiliseret kulstofstruktur. Det er en ion, der indeholder en positiv ladning. I disse ioner placeres den positive ion på det allyliske carbonatom (et allylisk carbonatom er det tilstødende atom til en dobbeltbinding). Primær allylisk carbocation er en allylic carbocation, hvor den positive ladning placeres på et primært carbonatom, mens sekundær allylic carbocation er en allylisk carbocation, hvor den positive ladning placeres på et sekundært carbonatom.