Nøgleforskel - Type I vs Type II Restriktionsenzym
Et restriktionsenzym, mere almindeligt omtalt som en restriktionsendonuklease, har evnen til at spalte DNA-molekyler i små fragmenter. Denne spaltningsproces sker nær eller ved et specielt genkendelsessted for DNA-molekylet kaldet et restriktionssted. Et genkendelsessted er typisk sammensat af 4-8 basepar. Afhængigt af spaltningsstedet kan restriktionsenzymer være af fire forskellige typer; Type I, Type II, Type III og Type IV. Ud over spaltningsstedet tages faktorer, såsom sammensætning, kravet til co-faktorer og tilstanden af målsekvensen i betragtning, når differentiering af restriktionsenzymer i fire grupper. Under spaltningen af DNA-molekylet kan spaltningsstedet enten være på selve restriktionsstedet eller i en afstand fra restriktionsstedet. Under processen med spaltning af DNA,restriktionsenzymerne skaber to snit gennem hver af sukkerphosphat-rygraden i den dobbelte helix af DNA. Restriktionsenzymer findes hovedsageligt i Achaea og bakterier. De bruger disse enzymer som en forsvarsmekanisme mod de invaderende vira. Restriktionsenzymerne spalter det fremmede (patogene) DNA, men ikke dets eget DNA. Dets eget DNA bliver beskyttet af et enzym kendt som methyltransferase, der foretager ændringer i værts-DNA'et og forhindrer spaltning. Type I-restriktionsenzym har et spaltningssted, der er væk fra genkendelsesstedet. Type II-begrænsningsenzymer spalter inden i selve genkendelsesstedet eller i tættere afstand til det. Dette er nøgleforskellen mellem type I og type II-begrænsningsenzym. Restriktionsenzymer findes hovedsageligt i Achaea og bakterier. De bruger disse enzymer som en forsvarsmekanisme mod de invaderende vira. Restriktionsenzymerne spalter det fremmede (patogene) DNA, men ikke dets eget DNA. Dets eget DNA bliver beskyttet af et enzym kendt som methyltransferase, der foretager ændringer i værts-DNA'et og forhindrer spaltning. Type I-restriktionsenzym har et spaltningssted, der er væk fra genkendelsesstedet. Type II-begrænsningsenzymer spalter inden i selve genkendelsesstedet eller i tættere afstand til det. Dette er nøgleforskellen mellem type I og type II-begrænsningsenzym. Restriktionsenzymer findes hovedsageligt i Achaea og bakterier. De bruger disse enzymer som en forsvarsmekanisme mod de invaderende vira. Restriktionsenzymerne spalter det fremmede (patogene) DNA, men ikke dets eget DNA. Dets eget DNA bliver beskyttet af et enzym kendt som methyltransferase, der foretager ændringer i værts-DNA'et og forhindrer spaltning. Type I-restriktionsenzym har et spaltningssted, der er væk fra genkendelsesstedet. Type II-begrænsningsenzymer spalter inden i selve genkendelsesstedet eller i tættere afstand til det. Dette er nøgleforskellen mellem type I og type II-begrænsningsenzym. Dets eget DNA bliver beskyttet af et enzym kendt som methyltransferase, der foretager ændringer i værts-DNA'et og forhindrer spaltning. Type I-restriktionsenzym har et spaltningssted, der er væk fra genkendelsesstedet. Type II-begrænsningsenzymer spalter inden i selve genkendelsesstedet eller i tættere afstand til det. Dette er nøgleforskellen mellem type I og type II-begrænsningsenzym. Dets eget DNA bliver beskyttet af et enzym kendt som methyltransferase, der foretager ændringer i værts-DNA'et og forhindrer spaltning. Type I-restriktionsenzym har et spaltningssted, der er væk fra genkendelsesstedet. Type II-begrænsningsenzymer spalter inden i selve genkendelsesstedet eller i tættere afstand til det. Dette er nøgleforskellen mellem type I og type II-begrænsningsenzym.
INDHOLD
1. Oversigt og nøgleforskel
2. Hvad er type I-begrænsningsenzym
3. Hvad er type II-begrænsningsenzym
4. Ligheder mellem type I og type II-begrænsningsenzym
5. Sammenligning side om side - type I vs type II-begrænsningsenzym i tabelform
6. Resume
Hvad er type I-begrænsningsenzym?
Type I-restriktionsenzymer er pentameriske proteiner sammensat af tre multi-underenheder: restriktionsunderenhed, methyleringsunderenhed og DNA-sekvensgenkendelsesunderenhed. Disse underenheder er ikke identiske. De blev oprindeligt identificeret i to forskellige former for Escherichia coli. Spaltningsstedet for disse restriktionsenzymer er til stede ved forskellige tilfældige punkter, typisk 1000 basepar væk fra genkendelsesstedet. Disse restriktionsenzymer kræver ATP, Mg 2+og S-adenosyl-L-methionin til dets aktivering. Type I-restriktionsenzymer har både methylase- og restriktionsaktiviteter. Bakterier bruger begrænsningsenzymer som en cellulær forsvarsmekanisme mod invaderende vira. Restriktionsenzymer spalter viralt DNA og ødelægger dem. Men for at forhindre spaltning af sit eget værts-DNA giver type I-restriktionsenzym en methyleringsbeskyttelse. Dette ændrer værts-DNA og forhindrer spaltning. Selvom disse restriktionsenzymer er biokemisk vigtige, anvendes de ikke i vid udstrækning, da de ikke tilvejebringer diskrete restriktionsfragmenter eller gelbindingsmønstre.
Hvad er type II-begrænsningsenzymer?
Type II-begrænsningsenzymer indeholder to identiske underenheder inden for deres struktur. Homodimerer dannes af type II-restriktionsenzymer med genkendelsesstederne. Genkendelsesstederne er typisk palindromiske og er ude. Den har en længde på 4-8 basepar. I modsætning til type I er Type II-restriktionsenzymets spaltningssted til stede på genkendelsesstedet eller til stede i tæt afstand til genkendelsesstedet.
Figur 02: Type II-begrænsningsenzymer
Disse restriktionsenzymer er biokemisk signifikante og er almindeligt tilgængelige kommercielt. Til aktivering kræver det kun Mg 2+. Det har ikke en methyleringsaktivitet og giver kun funktionen af begrænsningsaktivitet. Disse restriktionsenzymer binder til DNA-molekylerne som homodimerer og har evnen til at genkende symmetriske DNA-sekvenser såvel som asymmetriske sekvenser.
Hvad er ligheden mellem type I og type II begrænsningsenzymer?
- Type I og Type II-restriktionsenzymer er typer af enzymer er restriktionsendonukleaser, der involverer i spaltning af DNA-molekyler i mindre fragmenter.
- Begge er nyttige i molekylærbiologiske teknikker.
Hvad er forskellen mellem type I og type II begrænsningsenzym?
Diff artikel midt foran bordet
Type I vs Type II Restriktionsenzym |
|
| Type I-restriktionsenzym er et DNA-restriktionsenzym, der spalter DNA på tilfældige steder langt fra dets genkendelsessted. | Type II-restriktionsenzym er et DNA-restriktionsenzym, der spalter DNA i definerede positioner tæt på eller inden for genkendelsesstedet. |
| Sammensætning | |
| Type I restriktionsenzym er et komplekst enzym, der består af tre (03) ikke-identiske underenheder. | Type II-restriktionsenzym er et simpelt enzym, der består af to identiske underenheder. |
| Molekylær vægt | |
| Type I restriktionsenzym vejer 400.000 dalton. | Type II-restriktionsenzym har et vægtinterval på 20.000 - 100.000 dalton. |
| Sekvens af spaltning | |
| Spaltningssekvensen er ikke specifik i type I restriktionsenzym. | Type II-restriktionsenzym har en specifik sekvens af spaltning. |
| Spaltningssted | |
| Spaltningsstedet er 1000 nukleotider væk fra genkendelsesstedet i type I-restriktionsenzymer. | Spaltningsstedet er til stede ved genkendelsesstedet eller inden for en kort afstand fra genkendelsesstedet i type II-restriktionsenzym. |
| Kofaktorer til aktivering | |
| Type I-restriktionsenzym kræver ATP, Mg 2+ og S-adenosyl-L-methionin for dets aktivering. | Kun Mg2 + kræves for at aktivere type II-restriktionsenzym. |
| Methyleringsaktivitet | |
| Type I enzymet giver DNA beskyttelse ved methylering. | Ingen methyleringsaktivitet i type II-begrænsningsenzymer. |
| Enzymets aktivitet | |
| Type I restriktionsenzym tilvejebringer både endonuklease (restriktion) og methyleringsaktiviteter. | Type II-restriktionsenzym tilvejebringer kun restriktionsaktivitet. |
| Eksempler | |
| EcoK, EcoB | Hind II, EcoRI |
Resumé - Type I vs Type II Restriktionsenzym
Restriktionsenzymer kaldes biologisk saks, der spalter DNA-molekyler i mindre stoffer. Restriktionsenzymer er differentieret i 04 forskellige kategorier alt efter placeringen af spaltningsstedet med hensyn til genkendelsesstedet, tilstedeværende co-faktorer, sammensætning og tilstand af målsekvensen. Til dets aktivering, type I restriktionsenzymer kræver ATP, Mg 2+, og S-adenosyl-L-methionin. Spaltningsstedet af type I restriktionsenzym er typisk til stede 1000 basepar væk fra genkendelsesstedet og tilvejebringer methylase-beskyttelsen til DNA. Type II-begrænsningsenzymer kræver kun Mg 2+for dets aktivering. Spaltningsstedet er til stede på genkendelsesstedet eller tæt på det. Det har ikke en methyleringsaktivitet og er almindeligt tilgængeligt kommercielt. Dette er forskellen mellem type I restriktionsenzym og type II restriktionsenzym.
Download PDF-version af type I vs type II begrænsningsenzym
Du kan downloade PDF-version af denne artikel og bruge den til offlineformål som pr. Citatnote. Download venligst PDF-version her Forskellen mellem type I og type II-begrænsningsenzym.
