Hovedforskellen mellem iso- og neostrukturer er, at præfikset iso henviser til en organisk forbindelse, der indeholder alle carbonatomer undtagen en, der danner en kontinuerlig kæde, mens præfikset neo henviser til en organisk forbindelse, der indeholder alle carbonatomer undtagen to, der danner en kontinuerlig kæde.
Vi bruger præfikser i organisk kemi for at skelne et organisk molekyle fra et andet. Vi bruger disse præfikser sammen med navnet på forbindelsen. Da disse præfikser er specifikke for forskellige funktionelle grupper i organiske molekyler, kan vi let identificere organiske molekyler, selvom de har nært beslægtede kemiske strukturer.
