Hovedforskellen mellem aktiv transport og passiv transport er, at den aktive transport bevæger molekyler fra lav koncentration til høj koncentration mod koncentrationsgradienten via en semi-permeabel membran, mens passiv transport bevæger molekyler langs koncentrationsgradienten fra høj koncentration til lav koncentration. Desuden kræver aktiv transport energi til molekylære bevægelser i modsætning til passiv transport, som ikke kræver energi.
Aktiv transport og passiv transport er to processer, der beskriver bevægelser af molekyler fra en region til en anden region som et resultat af en koncentrationsgradient. Koncentrationsgradienten er en gradvis ændring i koncentration af partikler i en opløsning mellem to regioner og gradientresultater, når der er en ulig fordeling af ioner over cellemembranen. Så når partikler bevæger sig mod koncentrationsgradienten, er det aktiv transport, og hvis det er mod koncentrationsgradienten, er det en passiv transport.