Hovedforskellen mellem klorofyl A og B er, at klorofyl A er det primære fotosyntetiske pigment i planter og alger, mens klorofyl B er et tilbehørspigment, der opsamler energi og overføres til klorofyl A.
Klorofyl er en familie af naturlige pigmenter, der findes i planter og alger og er ansvarlig for deres grønne farve. Klorofyl absorberer energi fra sollys og bruger denne energi til at syntetisere kulhydrater fra vand og kuldioxid. Det er den proces, der kaldes fotosyntese, der opretholder livsprocesser i alle planter, da deres energibehov er opfyldt gennem denne proces. Desuden er fotosyntese den primære proces, der opretholder alle levende organismer, da planter er de primære producenter af alle fødekæder. Dyr og mennesker forbruger produkter af planter. I klorofylpigmentfamilien er der flere typer klorofylpigmenter. Blandt dem er klorofyl A og klorofyl B to typer klorofyl. De har en lignende struktur med en lille forskel i porphyrinringen. Klorofyl A har CH3 grupper i porphyrinringen, mens chlorophyll B har en CHO (aldehydgruppe) i porphyrinringen.
