Hovedforskellen mellem melatonin og serotonin er, at melatonin er et hormon, der hjælper os med at falde i søvn, mens serotonin er en neurotransmitter, der hjælper os med at føle os vågen, når vi står op næste dag.
Melatonin er et neurotransmitterlignende stof. Det er et hormon, der stiger i mørke. Serotonin er en neurotransmitter, der virker modsat melatonin. Serotoninniveauet stiger i sollys. Både melatonin og serotonin regulerer forskellige funktioner i vores kroppe, såsom appetit, humør og søvn. Kort fortalt er melatonin det stof, der hjælper os med at sove, mens serotonin er det stof, der hjælper os med at føle os vågen næste morgen.