Hovedforskellen mellem karyotype og idiogram er, at karyotype er det faktiske billede af de samlede kromosomer i en celle, mens idiogram er et skematisk diagram over en karyotype, der illustrerer alle kromosomkort.
Et sæt kromosomer repræsenterer genomet og den genetiske information af en organisme. Hvert kromosom har en unik form, størrelse og et sæt gener. Antallet og fysiske strukturer af kromosomer afslører vigtig information om organismen. Karyotyping er en teknik, der udføres for at undersøge det komplette sæt kromosomer i en celle. Samlede kromosomer indsamles og analyseres under denne test for at bestemme, om der er numeriske eller strukturelle abnormiteter i kromosomer. Det faktiske billede, der viser de samlede kromosomer i en celle, er karyotypen, mens det skematiske diagram over de samlede kromosomer i en celle er idiogrammet. Begge er vigtige i cytogenetiske undersøgelser.
