Hovedforskellen mellem pepsin og renin er, at pepsin, som er et af de vigtigste fordøjelsesenzymer, er en protease udskilt af maven, mens renin er et enzym og også et hormon produceret af juxtaglomerulære celler i nyrerne.
Proteaser er enzymer, der hydrolyserer peptidbindinger og nedbryder proteiner til peptider eller aminosyrer. Pepsin er en protease til stede i mavesaften. Det er et af de vigtigste fordøjelsesenzymer, der bryder proteinholdige fødevarer i peptider og aminosyrer. I modsætning hertil er renin et enzym og en asparaginprotease. Det er initiativenzymet i renin-angiotensinsystemet. Renin fungerer som et hormon og hjælper med at kontrollere blodtrykket.