Hovedforskellen mellem totalt celletal og levedygtigt celletal er, at det totale celletal estimerer alle celler inklusive både levende og døde mikrobielle celler i en prøve, mens levedygtigt celletal kun estimerer de levende mikrobielle celler i en prøve.
At tælle antallet af organismer inden for en befolkning anses for nødvendigt for det mest eksperimentelle arbejde. Derfor forsøger vi at analysere antallet af mikrober i en prøve ved hjælp af direkte og indirekte metoder. Direkte målinger involverer metoder, der tæller cellenumre direkte. Indirekte målinger involverer måling af nogle parametre, der kan relateres til celleantal, såsom celledensitet, tørvægt osv. Nogle metoder kvantificerer kun de levende mikrobielle celler i en prøve. Levedygtig celletælling er en sådan metode. Direkte mikroskopiske optællinger kvantificerer alle celler i et kendt volumen medium / prøve ved hjælp af et mikroskop. Derfor tæller det både levende og døde celler. Det er en type af et samlet antal celler.