Hovedforskellen mellem Golgi Bodies og Mitochondria er på den funktion, de udfører. Hovedfunktionen for Golgi-legemer (eller Golgi-apparater) er ændring, sortering og emballering af proteiner til sekretion, mens mitokondriernes hovedfunktion er produktionen af celleens energivaluta gennem åndedræt.
Eukaryote celler indeholder cellulære organeller, såsom Golgi-legemer, mitokondrier, lysosomer, ribosomer, kerne osv. Disse er vitale organeller, der er nødvendige for de cellulære funktioner. Golgi-legemer er en del af endomembransystemet, der består af vesikler og foldede membraner, mens mitokondrier er dobbeltmembranbundne bønneformede organeller, der findes i eukaryote celler.