Hovedforskellen mellem Chlamydia og Rickettsia er deres transmissionstilstand. Chlamydia transmitterer fra person til person, mens Rickettsia transmitterer med leddyrvektorer. En anden hovedforskel mellem Chlamydia og Rickettsia er, at Chlamydia ikke kan producere ATP, mens Rickettsia kan producere noget ATP, da de har et cytochrom-system.
Chlamydia og Rickettsia er to bakterielle slægter af Kingdom Monera. Disse bakterier er gramnegative og er obligatoriske intracellulære parasitter. De er kun i stand til at overleve inde i værtscellen eller organismen. De er medicinsk vigtige, da de forårsager forskellige sygdomme hos dyr og mennesker.