Hovedforskellen mellem molekylær bevægelse og diffusion er, at molekylær bevægelse er bevægelse af molekyler inde i et stof uden nogen ekstern indflydelse, mens diffusion er bevægelse af molekyler fra et område med høj koncentration til et område med lavere koncentration.
Molekylær bevægelse og diffusion er meget vigtige som forklaringer på stoffers molekylers opførsel. Alt stof indeholder partikler; atomer, ioner eller molekyler. oftest kan vi finde molekyler i stedet for atomer eller ioner, fordi molekyler er mere stabile. Desuden er alle former for stof altid i en af tre tilstander; gas, flydende eller fast tilstand. Molekylernes bevægelse i disse tre tilstande er beskrevet ved molekylær bevægelse og diffusion.