Hovedforskellen mellem alfa- og betahydroxysyrer er, at alfahydroxysyren (AHA) har en carboxylsyregruppe og en hydroxylgruppe adskilt af et carbonatom, mens en betahydroxysyre (BHA) indeholder en carboxylsyregruppe og en hydroxylgruppe adskilt af to kulstofatomer.
Hydroxy syrer er organiske forbindelser, der begge har en carboxylsyregruppe og en hydroxylgruppe i det samme molekyle. Kulstofatomer, som disse funktionelle grupper er bundet til, er tæt på hinanden. Derfor kan vi navngive dem som alfa, beta eller gamma i henhold til antallet af carbonatomer, der adskiller disse funktionelle grupper. Lad os diskutere flere detaljer i nedenstående tekst.