Hovedforskellen mellem substrat og aktivt sted er, at substratet er en kemisk forbindelse, der kan gennemgå en kemisk reaktion, mens det aktive sted er et specifikt område på et enzym.
Enzymer er biologiske katalysatorer. Disse er proteiner, der kan reducere aktiveringsenergien i en kemisk reaktion for at reducere energibarrieren ved denne reaktion. Derfor kan det øge reaktionshastigheden. Reaktanten af reaktionen, som enzymer involverer, er "substratet". Dette substrat binder sig til enzymets aktive sted. Reaktionerne finder sted der. Til sidst frigiver det reaktionens produkter.
