Hovedforskellen mellem ekstern og intern befrugtning er, at foreningen af mandlige og kvindelige kønsorganer i ekstern befrugtning sker uden for den kvindelige krop, mens foreningen af mandlige og kvindelige kønsorganer i intern befrugtning sker inden i den kvindelige krop.
Befrugtning er den vigtigste begivenhed, der finder sted i seksuel reproduktion. Med andre ord er det den vitale proces, der skaber et afkom fra to forældre. To typer gameter; mandlig gamete og kvindelig gamete forene sig med hinanden under befrugtningen. Derfor kan befrugtning kun ses i seksuel reproduktion. Kønsceller er haploide, og når de smelter sammen, producerer den en diploid celle kaldet zygote. Derefter deler mitosen zygoten og udvikler sig til et nyt individ. Her er der to typer befrugtninger baseret på den måde, de opstår på. De er den eksterne befrugtning og den interne befrugtning. Ekstern befrugtning, som navnet antyder, forekommer uden for den kvindelige krop, mens den indre befrugtning sker inden i den kvindelige krop.
