Hovedforskellen mellem lysosomer og ribosomer er, at lysosomerne er cellernes steder med nedbrydende affald, mens ribosomerne er cellestederne til syntetisering af proteiner.
En celle har forskellige komponenter, og disse komponenter spiller forskellige roller inden i cellen, der hjælper med at overleve levende organismer. Blandt de forskellige cellekomponenter er lysosomer og ribosomer to vigtige cellekomponenter. Disse to strukturer udfylder to forskellige funktioner i cellen. Derfor er begge afgørende for cellefunktion. Lysosomer indeholder en række fordøjelsesenzymer, der hjælper med at nedbryde de uønskede ting, der er akkumuleret inde i cellen. På den anden side er ribosomer essentielle i proteinsyntese. Selvom de er essentielle cellekomponenter, er lysosomer kun til stede i eukaryote celler, mens ribosomer er til stede i både eukaryote og prokaryote celler.